Alinhamentos com inversões

Alair Pereira do Lago

IME-USP

Sexta-feira, 8 de novembro de 2002, 14:30

Sala 268, Bloco A, IME-USP

Resumo:

Nesta palestra discutiremos o problema do alinhamento de seqüências que leve em consideração não somente eventos biológicos como mutações, inserções e deleções, mas também inversões. Apresentamos uma hipótese simplificadora a relativamente realista para as inversões e derivamos um algoritmo polinomial (n4) exato para o problema.

Mostramos como o algoritmo é aplicado ao alinhamento de regiões altamente conservadas entre duas espécies próximas.


Last modified: Tue Nov 5 13:40:59 EDT 2002