Combinatorics Research Group
Posdocs, Ph.D. and MSc. Students
Posdocs
- Julia Boettcher, PhD, Technische Universität München, Germany
Project's title: Problemas de imersão e empacotamento em teoria
extremal dos grafos
Supervisor: Prof. Y. Kohayakawa
Post-doc since October 2009 (Bolsa da Comunidade Europeia e FAPESP).
Ph.D. Students
- Alexandre Silva Freire, MSc., USP
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Project's title: Cobertura de grafos por bicliques
Bolsa da CAPES.
- Álvaro Junio Pereira Franco, MSc., USP
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Project's title: undefined
Bolsa da CAPES.
- Daniel Aparecido Geraldini
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Project's title: undefined
Bolsa do CNPq.
- Francisco Elói Soares de Araujo, MSc., USP
Advisor: Prof. J.A. Soares
Project's title: Alinhamento de várias seqüências
- Guilherme Oliveira Mota, MSc., UFC
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Project's title: Combinatória assintótica de estruturas esparsas e regularidade
Bolsa da FAPESP.
- Karla Roberta Pereira do
Nascimento, MSc., UFG
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Project's title: Recoloração convexa de árvores filogenéticas
Bolsa do CNPq.
- Mário Leston Rey, MSc., USP
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Project's title: Partição das arestas de um grafo em um número mínimo de caminhos
- Márcio Takashi Iura Oshiro , MSc., USP
Advisor: Prof. C.G. Fernandes
Project's title: Problemas de escalonamento
Bolsa da CAPES.
- Rafael Crivellari Saliba Schouery
Advisor: Prof. C.G. Fernandes
Project's title: Teoria dos jogos algorítmica
Bolsa da FAPESP.
MSc. Students
- Alex Andre da Costa Soares
Advisor: Prof. C.G. Fernandes
Project's title: Árvores geradoras com número máximo de folhas
- Alexandre Luiz Junqueira Hadura Albano
Advisor: Prof. A.P. do Lago
Project's title: Reticulados de conceitos
Bolsa do CNPq.
- Ander Conselvan de Oliveira
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Project's title: Comparação entre uma solução combinatória e um método de planos
de corte para o problema do emparelhamento de peso máximo
Bolsa da CAPES (concluída).
- André Tadeu de Carvalho
Advisor: Prof. A.P. do Lago
Project's title: Extração de informação
- Atol Fortin de Oliveira
Advisor: Prof. C.G. Fernandes
Project's title: Teoria dos jogos algorítmica
Bolsa da FAPESP.
- Camila Mari Matsubara
Advisor: Prof. J. Coelho de Pina
Project's Title: O problema da coleta de prêmios (provisório)
- César Gamboa Machado
Advisor: Prof. J. Coelho de Pina
Project's Title: Teoria dos jogos algorítmica
Bolsa da CAPES.
- Guilherme Puglia Assunção
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Project's title: Representações duais retangulares de
grafos planares
Bolsa do CNPq.
- Gustavo Akio Tominaga Sacomoto
Advisor: Prof. A.P. do Lago
Project's title: Árvores de sufixos: caracterização, combinatória, extensões e aplicações
Bolsa da CAPES.
- Joel Silva Uchoa
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Project's Title: Caminhos mínimos com restrições
Bolsa da CAPES (concluída).
- Leonardo Marchetti
Advisor: Prof. C.G. Fernandes
Project's title: undefined
- Letícia Gindri
Advisor: Prof. N. Kobayashi
Project's title: undefined
- Marcelo de Rezende Martins
Advisor: Prof. A.P. do Lago
Project's title: Estudo exploratório em métodos imunológicos para deteção de fraude
Bolsa do CNPq (concluída).
- Marli Aparecida Guarino
Advisor: Prof. A.P. do Lago
Project's title: Análise de regressão em dados clínicos
- Murilo Santos de Lima
Advisor: Prof. C.G. Fernandes
Project's title: Aproximação de métricas arbitrárias por métricas arbóreas e aplicações
Bolsa do CNPq.
- Paulo Victor Teixeira Eufrasio
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Project's title: undefined
Bolsa da CAPES.
- Pedro Henrique Simões de Oliveira
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Project's Title: Estudo do problema de dimensionamento de lotes
- Rafael da Ponte Barbosa
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Project's title: Problemas de cobertura por sensores
Bolsa da FAPESP.
- Raphael Henrique Ribas
Advisor: Prof. C.G. Fernandes
Project's title: Branch and bound para problemas de escalonamento
Bolsa do CNPq.
- Roberto Freitas Parente
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Project's title: Orientações de grafos
Bolsa do CNPq.
- Tássia Camões Araujo
Advisor: Prof. A. Mandel
Project's title: undefined
Bolsa do CNPq.
- Tharsis Tuani Pinto Souza
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Project's title: undefined
- Thiago Serra Azevedo Silva
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Project's title: Programação com restrições aplicada a um
problema de escalonamento com movimentação de recursos e
administração de inventário
- Wanderley Guimarães
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Project's title: Conjuntos dominantes em grafos
Former Post-docs
- Carlos Hoppen, PhD, University of Waterloo
Project's title: A análise de estruturas discretas de grandes
proporções
Supervisor: Prof. Y. Kohayakawa
Post-doc scholarship from FAPESP, March 2008 to February 2010.
Currently at UFRGS.
- Christiane Neme Campos, Dr., Universidade Estadual de Campinas
Project's title: Aspectos teóricos, estruturais e de otimização
de alguns problemas em grafo
Supervisor: Prof. Y. Wakabayashi
Post-doc scholarship from FAPESP, April 2007 to January 2009.
Currently at IC-UNICAMP.
- Frédéric Chataigner, Dr., Université Paris 7
Project's title: Approximation Algorithms, Complexity and
Non-Approximability of Problems on Graphs
Supervisor: Prof. Y. Wakabayashi
PosDoc scholarship from FAPESP, September 2005 to September 2006.
- Jozef Skokan, PhD, Emory Univ.
Project's title: Applications of the Regularity Method
NSF Fellowship (International Research Fellowship Program), USA
From October 2003 - March 2005, and PosDoc FAPESP, from April
2005 to June 2006.
Currently at the London School of Economics.
- Maya Stein, Dr. rer. nat., Universität Hamburg
Project's title: Finite and Infinite Problems in Graph
and Hypergraph Theory
Post-doc scholarship from FAPESP, October 2005 to October 2008.
Currently at CMM, Universidad de Chile, Santiago.
Former PhD Students
- André Fujita, PhD.,
USP - 2007 (Primeiro lugar no CTD'08, Prêmio
CAPES de Tese, 2008 - Menção Honrosa)
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Thesis' title: Análise de dados de expressão gênica:
normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias
Currently at DCC-IME-USP.
- Augusto Fernandes Vellozo, PhD., USP - 2007
Advisor: Prof. A.P. do Lago
Thesis' title: Alinhamento de seqüências com rearranjos
Currently doing a PosDoc at Université Claude Bernard, Lyon 1.
- Estela Maris
Rodrigues, PhD., USP - 2003
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Thesis' title: Algoritmos para Comparação de Árvores
Filogenéticas e o Problema dos Pontos de Recombinação
Currently at Mackenzie/SP.
- Fábio H. Viduani
Martinez, PhD., USP - 2004
Advisor: Prof. J.A. Soares
Thesis's title: Aproximações para Restrições do Problema de
Steiner em Grafos
Currently at DCT-UFMS.
- Flávio Keidi Miyazawa,
Ph.D., USP - 1997
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Thesis' title: Algoritmos de Aproximação para Problemas de
Empacotamento (Primeiro lugar no CTD'98)
Currently at IC-UNICAMP.
- Gerardo Valdisio Rodrigues Vianna, PhD., UFC - 2007
Co-Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Thesis' title: Técnicas para construção de árvores
filogenéticas
Currently at UFC and UECE.
- Glauber Ferreira
Cintra, PhD., USP - 2004
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Thesis' title: Algoritmos para Problemas de Corte de
Guilhotina Bidimensional
Currently at Faculdade 7 de Setembro, Ceará.
- Gordana Manic,
PhD., USP - 2006
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Thesis's title: Empacotamento de Subgrafos em Grafos
(Prêmio Capes de Teses de Doutorado 2007)
Currently at UFABC.
- Jair Donadelli Júnior, PhD, USP
- 2002
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Thesis' title: Resultados de Ramsey e de Densidade para
Grafos Pseudo-Aleatórios Esparsos Pseudo-Aleatórios Esparsos
Currently at DI-UFPR.
- Liliane Rose Benning
Salgado, PhD., USP - 2004
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Thesis' title: Algoritmos de Aproximação para Partições Conexas em Grafos
Currently at DI-UFPE.
- Marco Aurélio Stefanes,
PhD, USP - 2003
Advisor: Prof. J.A. Soares
Thesis' title: Algoritmos Paralelos de Granularidade
Grossa em Grafos Bipartidos Convexos
Currently at DCT-UFMS.
- Orlando Lee, PhD, USP
- 1999
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Thesis's title: Cobertura por Circuitos em Grafos Mistos
Currently at IC-UNICAMP.
- Pavlos Bahia Konstadinidis, MSc., USP
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Project's title: Tópicos em combinatória
Bolsa do CNPq.
- Renato J. da S. Carmo,
PhD., USP - 2005 , PhD., USP - 2005 (Segundo lugar no CTD'05)
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Thesis's title: Dois Problemas de Busca.
Currently at DI-UFPR.
- Rudini Menezes Sampaio
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Project's title: Limites de seqüências de permutações
- Said Sadique Adi,
PhD., USP - 2005
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Thesis's title: Montagem de Fragmentos de DNA
Currently at DCT-UFMS.
Former MSc Students
- Alexandre Noma, MSc., USP - May/03
Advisors: Prof. J.C. de Pina and Prof. C.G. Fernandes
Dissertation's title: Algoritmos de Planaridade em Grafos
- Alexandre Scalzitti, MSc., USP - October/99
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Dissertation's title: Convergência na Teoria dos Grafos Aleatórios
- Álvaro Junio Pereira Franco, MSc., USP - June/09
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Project's title: Algoritmos e estruturas de dados para
buscas em janelas
- Ana Lúcia Lima Marreiros, MSc., USP - August/03
Advisor: Prof. J.C. de Pina
Dissertation's title: Método Primal-Dual
- Andrea Tieme Nakasato, MSc., USP - April/08
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Dissertation's title: Ordenação por reversão
- Antonio João Ferreira Francisco, MSc., USP - March/06
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Project's title: Algoritmos de aproximação para o projeto de redes
seguras
- Aritanan Borges Garcia Gruber, MSc., USP - March/01
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Dissertation's title: Algoritmos e Estruturas de Dados para
Problemas em Grafos Dinâmicos
- Armando Ramos Gouveia, MSc., USP - November/98
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Dissertation's title: Provas Holográficas de Tamanho Quase-linear
- Bruno Leite, MSc., USP - December/04
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Dissertation's title: Versões probabilísticas de alguns resultados da
teoria combinatória dos números
- Carlos Henrique Cardonha, MSc., USP - September/06
Advisor: Prof. C.G. Fernandes
Dissertation's title: Sistemas Interativos de Prova Clássicos e Quânticos
- Carlos R. Pantaleon Dionisio, MSc., USP - February/00
Advisor: Prof. J.C. de Pina
Dissertation's title: Geometria Computacional de Pontos em Movimento
- Cássio Polpo de Campos, MSc., USP - December/00
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Dissertation's title: Algoritmos Dinâmicos em Geometria Computacional
- César Alberto Bravo Pariente, MSc., USP - November/96
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Dissertation's title: Um Método Probabilístico em Combinatória
- Christian Tjandraamadja, MSc., USP - July/10
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Dissertation's title: Subseqüência comum mais longa sem
repetições e variantes
- Cristiane Maria Sato, MSc., USP - April/08
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Dissertation's title: Homomorfismos de grafos
- Daniel Morgato Martin, MSc., USP - July/05
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Dissertation's title: Coloração de Grafos e o Método Probabilístico
- Domingos Dellamonica Júnior, MSc., USP - March/07
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Dissertation's title: Extração de aleatoriedade a partir de fontes defeituosas
- Domingos Soares Neto, MSc., USP - September/08
Advisor: Prof. J.A. Soares
Dissertation's title: Filtros para a busca e extração de
padrões aproximados em cadeias biológicas
- Edésio R. Sibrão, MSc., USP - December/99
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Dissertation's title: Escalonamento em Sistemas de Produção: um Estudo
de Caso
- Eduardo Garcia de Freitas, MSc., USP - December/00
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Dissertation's title: Algoritmos Cinéticos em Geometria Computacional
- Eduardo Kazuaki Gondo, MSc., USP - May/02
Advisor: Prof. C.G. Fernandes
Dissertation's title: Árvores k-Restritas e Algoritmos de
Aproximação para Árvores de Steiner
- Eduardo Tengan, MSc., USP - May/02
Advisor: Prof. A. Mandel
Dissertation's title: Automorfismo de Grafos
- Eider Silva de Oliveira, MSc., USP - August/06
Advisor: Prof. A. Mandel
Dissertation's title: Sistema de arquivos especializado para correio eletrônico
- Estela Maris Rodrigues, MSc., USP - February/97
Advisor: Prof. M.A. Gurgel
Dissertation's title: Fatores e Empacotamentos em Grafos
- Fábio Pisaruk, MSc., USP - February/09
Advisor: Prof. J.C. de Pina
Dissertation's title: k-caminhos mínimos
- Fabricio Siqueira Benevides, MSc., USP - March/07
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Dissertation's title: Teoria de Ramsey para circuitos e caminhos
teoria de Ramsey para grafos
- Fernando Mário de Oliveira Filho, MSc., USP - June/05 (Primeiro lugar no CTD'05)
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Dissertation's title: O problema de Steiner com grupos
- Francisco Elói Soares de Araújo, MSc., USP - August/98
Advisor: Prof. J.A. Soares
Dissertation's title: Rearranjo de Genomas por Reversões
- Glauber Ferreira Cintra, MSc., USP - July/98
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Dissertation's title: Algoritmos Híbridos para Problemas de Corte
Unidimensional (Primeiro lugar no VI Concurso CLEI/UNESCO'99)
- Gordana Manic, MSc., USP - October/01
Advisor: Prof. P. Feofiloff
Dissertation's title: Colorações Restritas de Grafos
- Hammurabi das Chagas Mendes, MSc., USP - August/08
Advisor: Prof. C.G. Fernandes
Dissertation's title: Estruturas de Dados Concorrentes:
um Estudo de Caso em Skip Graphs
- Jair Donadelli Júnior, MSc., USP - March/96
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Dissertation's title: Arranjos de Subespaços, Colapso de
Complexos Simpliciais e Complexidade Computacional
- José Osvaldo Couto Horta, MSc., USP - October/01
Advisor: Prof. J.C. de Pina
Dissertation's title: Estimativas de Entropia para Seqüências de DNA
- Juliana Barby Simão, MSc., USP - March/09
Advisor: Prof. J.C. de Pina
Dissertation's title: Submodularidade em otimização combinatória
- Lennon de Almeida Machado, MSc., USP - January/10
Advisor: Prof. A.P. do Lago
Dissertation's title: Busca indexada de padrões em textos comprimidos
- Luiz Carlos Rozante, MSc., USP - January/02
Advisor: Prof. J.A. Soares
Dissertation's title: Algoritmos para Predição de Estrutura
Secundária do RNA
- Luiz Daniel Creão Augusto, MSc., USP - March/10
Advisor: Prof. A.P. do Lago
Dissertation's title:
- Manoel Fernando Alonso Gadi, MSc., USP - April/08
Advisor: Prof. A.P. do Lago.
Dissertation's title: Uma comparação de métodos de
classificação aplicados à detecção de fraude em cartões de crédito
- Marcel Kenji de Carli Silva, MSc., USP - April/07
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Dissertation's title: Relações min-max em otimização combinatória
- Marcelo Hashimoto, MSc., USP - February/07
Advisor: Prof. J.C. de Pina
Dissertation's title: Bases de Hilbert
- Marcio Takahashi Iura Oshiro, MSc., USP - May/10
Advisor: Prof. J.C. de Pina
Dissertation's title: k-árvores de custo mínimo
- Marco Aurélio Stefanes, MSc., USP - February/98
Advisor: Prof. J.A. Soares
Dissertation's title: Algoritmos e Implementações Paralelas para
Florestas Geradoras Mínimas
- Márcio Grossi de Almeida, MSc., USP - June/00
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Dissertation's title: Números de Ramsey Induzidos e Semi-induzidos
- Mário Leston Rey, MSc., USP - November/99
Advisor: Prof. P. Feofiloff
Dissertation's title: T-Junções, T-cortes e Funções Conservativas
- Marko Loparic, MSc., USP - January/96
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Dissertation's title: Uma Aplicação do Método de Branch and Cut a um
Problema de Roteamento de Veículos (Segundo lugar
no CTD'97)
- Mauricio Silva de Moura, MSc., USP - February/09
Advisor: Prof. J.C. de Pina
Dissertation's title: Método de Robertson-Seymour para caminhos disjuntos
- Nelio Alves Pereira Filho, MSc., USP - August/04
Advisor: Prof. A. Mandel
Dissertation's title: Serviços de Pertinência para Clusters de Alta Disponibilidade
- Pavlos Bahia Konstadinidis, MSc., USP - February/05.
Advisor: Prof. Y. Kohayakawa
Dissertation's title: Grafos distância
- Rafael Pereira Luna, MSc., USP - April/06
Advisor: Prof. C.G. Fernandes
Dissertation's title: Implementações do método de
aproximação primal-dual aplicado ao problema da floresta de
Steiner
- Rafael Plana Maranzato, MSc., USP - March/10
Advisor: Prof. A.P. do Lago
Dissertation's title: Identificação de fraude no mercado de transações online
- Renato da Silva Carmo, MSc., USP, 94 (Primeiro lugar no CTD'95)
Advisor: Y. Wakabayashi
Dissertation's title: O Problema do Subgrafo Planar Ótimo
- Renato Pinheiro Freme Lopes Lucindo, MSc., USP - March/07
Advisor: Prof. Y. Wakabayashi
Project's title: Partição de Grafos em Subgrafos Conexos
Balanceados
- Rodrigo Souza de Castro, MSc., USP - June/03
Advisor: Prof. A.P. do Lago
Dissertation's title: Cache comprimido adaptativo: estudo, projeto e implementação
- Rogério Theodoro Brito, MSc., USP - September/03
Advisor: Prof. J.A. Soares
Dissertation's title: Alinhamento de Múltiplas Seqüências
- Said Sadique Adi, MSc., USP - April/00
Advisor: Prof. C.E. Ferreira
Dissertation's title: Ferramentas de Auxilio ao
Sequenciamento de DNA por montagem de fragmentos: um estudo
comparativo
- Shigueo Isotani, MSc., USP - April/02
Advisor: Prof. J.C. de Pina
Dissertation's title: Algoritmos para Caminhos Mínimos
- Wendel Scardua, MSc., USP - March/09
Advisor: Prof. A.P. do Lago
Dissertation's title: Métodos de Aprimoramento de Resultados em
Sistemas de Recuperação de Informação
Last modified: Wed Aug 25 15:33:31 BRT 2010