Lista de Discussão da Disciplina Biologia Computacional
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como contar o num. de bases de um DNA
- Subject: como contar o num. de bases de um DNA
- From: Luiz Carlos Rozante <rozante@ime.usp.br>
- Date: Wed, 29 Sep 1999 15:56:47 -0300
Olá pessoal,
perguntei a um professor do IB como sabemos de antemão o tamanho de
uma moléla de DNA; ou seja, antes de fazermos o seu sequenciamento?
Por exemplo: o Projeto Genoma tenta sequenciar o DNA humano, mas como
se descobriu que ele tem aproximadamente 9 bilhoes de bases?
Ele respondeu:
> Sua duvida e' bastante pertinente, pois a resposta nao e' obvia
>para um nao biologo. A estimativa do numero de bases e' feita atraves de
>uma tecnica chamada citofotometria. O principio e' o seguinte: Uma
>camada de celulas e' disposta sobre uma lamina de microscopio. Estas
>celulas sao fixadas (para que o material macromolecular nao se desprenda
>da laminula) e coradas com um reagente que se liga especificamente ao DNA
>(tecnicamente, o corante de Feulgen, quimico alemao do inicio do seculo
>que inventou a tecnica que consiste no uso do corante fucsina basica). Em
>seguida a lamina e' submetida a um equipamento especial chamado
>citofotometro, Um feixe de luz de uma cor que e' absorvida pelo DNA ligado
>ao corante de Feulgen varre o campo onde existem normalmente varios
>nucleos. Quanto mais DNA, mais luz e' absorvida, detectada
>por uma celula fotoeletrica. A integracao da leitura, da uma ideia da
>quantidade de DNA por nucleo, em geral na ordem de picogramas. Dai, por
>uma "regra de tres", estima-se a quantidade de bases. A coloracao fica bem
>bonita, com os nucleos rosados. A saida do equipamento e' algo do tipo
>(por nucleo):
>
>
> 1 2 3 4 1 2
> 1 2 4 6 7 8 3 1
> 2 3 4 12 14 12 4 3 4 1
> 1 5 7 8 19 23 22 24 8 3 2
> 1 4 12 23 34 23 34 23 8 2
> 1 3 17 23 45 23 12 13 11 7 3
> 1 3 12 14 22 23 12 8 5
> 2 4 5 5 7 7 8 3 1
> 1 3 4 6 6 3 1
> 1 2 1
>
> Em geral tomam-se varias medidas para se obter um resultado medio.
>Lembre que a celula tem um nucleo diploide (dois genomas por celula), ou
>seja, depois o resultado e' dividido por 2.
> Espero que sua duvida tenha sido resolvida.
>
> Abracos,
>
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