Estrutura primária do RNA e sua relação com proteínas

[Rogerio Brito <rbrito@iname.com>]

	Oi, pessoal.

	Na aula de ontem, estávamos falando sobre como podemos ter uma
	idéia da estrutura secundária do RNA a partir de sua estrutura
	primária (estrutura primária = seqüência de nucleotídeos).

	Logo no início da aula, estávamos comentando algo sobre a
	afirmação dos biólogos de que a estrutura das moléculas
	parecem determinar sua(s) função(ões).

	Em pouco tempo surgiu uma discussão sobre o fato de que
	poderia ser possível que duas moléculas de RNA tivessem
	estruturas primárias diferentes, mas estruturas secundárias,
	terciárias e quaternárias iguais e, mesmo assim, tivessem
	a mesma função.

	Eu havia comentado que eu achava que isso fosse possível, fui
	dar uma pesquisada e aqui estão algumas considerações
	(completamente leigas e desorientadas, diga-se de passagem):

	Lembremos, inicialmente, que o final do processo de síntese de
	proteínas (i.e., o processo de tradução) é determinado pela
	seqüência de bases nitrogenadas do RNA mensageiro. Neste
	contexto, cada trinca de bases nitrogenadas (um códon) é
	mapeada em um aminoácido que irá formar, junto com diversos
	outro aminoácidos, a nova proteína (excepcionalmente, um códon
	pode não ser mapeado em um aminoácido, sendo usado como um
	"ponto final" para o processo de tradução).

	Pois bem, como há 4^3 = 64 possíveis códons e apenas 20
	aminoácidos + 1 "ponto final", obviamente qualquer função que
	mapeia códons em aminoácidos ou pontos finais não pode ser
	injetora (era isso que eu estava dizendo com "mais de uma
	trinca pode ser levada em um aminoácido").

	Dando uma olhada no livro na página 10 do livro do Meidanis,
	nós vemos que, por exemplo, o códon GGG mapeia o mesmo
	aminoácido que GGC.

	Logo, se tivermos duas moléculas r_1, r_2 de mRNA com

		r_1 = \alpha GGG \beta
		r_2 = \alpha GGC \beta,

	onde \alpha e \beta são algumas seqüencias de bases, então
	tanto r_1 e r_2 codificarão a mesma proteína, ou seja, embora
	tenham estruturas primárias diferentes, elas têm a mesma
	função.  O que não é claro para mim é se essas duas moléculas
	r_1 e r_2 teriam ou não as mesmas estruturas secundárias,
	terciárias e quaternárias.

	Alguém tem algum comentário? (TM Zé Augusto) :-)


	[]s, Roger...

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  Rogerio Brito - rbrito@iname.com - http://www.ime.usp.br/~rbrito/
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