Lista de Discussão de MAC 5726 - Biologia Computacional

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duvida do projeto 3

	Ola !!!
	Estou com uma dúvida na transformação da matriz de distâncias, ou
seja, transformar a matriz com valores dij para valores Dij.
	Primeira dúvida 
		1) Dij = dij -(ri -rj) ou Dij = dij -ri -rj ???
		2) como calcula-se o ri ?? Pelo algoritmo temos que
ri=(1/(n-2))*(somatoria dos dik para todo os ck) ?? Eu não entendi direito
essa somatória !!! A variavel n é fixa ?? e o ck quem é, pelo que entendi
cada ck (c1, c2, .. cn) seria uma sequencia que deveria ser alinhada, ou
seja os ck seriam seq 1, seq 2, seq 3, seq n  ???

	Não sei se estou complicando mas vou dar um exemplo :

 	Vamos em um exemplo se temos umas matriz 4X4 da forma
   1   2   3   4

1  - 0.3 0.4 0.6 
2  - -   0.5 0.5
3  - -   -   0.8
4  - -   -   -

para calcular a matriz Dij teriamos que fazer por exemplo

D12 = d12 - (r1 - r2)
D12 = 0.3 - (r1 -r2)
r1 = (1/(4-2)*somatoria dos dik para todo ck)
r2 = (1/(4-2)*somatorio dos djk para todo ck)

como faço a conta ???
e para  D14 ???



se alguem puder me ajudar fico agradecido !!!


 Seiji Isotani <seiji@linux.ime.usp.br> 
                 
         ICQ UIN 17252857